Ano ang Dapat Malaman
- Ang ilang mga PDB file ay mga program database file.
- Buksan ang isa gamit ang text editor o program tulad ng Geneious.
- I-convert sa ibang format na may parehong program na nagbubukas ng iyong partikular na database file.
Ipinapaliwanag ng artikulong ito kung ano ang PDB file, kung paano buksan ang isa, at kung paano i-convert ang isa sa ibang format.
Ano ang PDB File?
Ang isang file na may extension ng PDB file ay malamang na isang program database file na ginagamit upang hawakan ang impormasyon sa pag-debug tungkol sa isang program o module, tulad ng isang DLL o EXE file. Kung minsan ay tinatawag silang mga symbol file.
Ang file ay nagmamapa ng iba't ibang bahagi at pahayag sa source code sa huling pinagsama-samang produkto nito, na magagamit ng debugger upang mahanap ang source file at ang lokasyon sa executable kung saan dapat nitong ihinto ang proseso ng pag-debug.
Maaaring nasa Protein Data Bank file format ang ilang PDB file. Ito ay mga plain text file na nag-iimbak ng mga coordinate tungkol sa mga istruktura ng protina.
Iba pang mga PDB file ay maaaring gawin sa Palm Database o PalmDOC file format at gamitin sa PalmOS mobile operating system; ang ilang mga file sa format na ito ay gumagamit ng. PRC file extension sa halip. Ang isa pang format na gumagamit ng parehong extension na ito ay ang Tanida Demo Builder.
Paano Magbukas ng PDB File
Gumagamit ang iba't ibang program ng sarili nilang PDB file upang mag-imbak ng data sa ilang uri ng structured database format, kaya ginagamit ang bawat application para buksan ang sarili nitong uri.
Ang Genious, Quicken, Visual Studio, at Pegasus ay ilan lamang sa mga halimbawa ng mga program na maaaring gumamit ng file bilang isang database file. Maaaring gumana rin ang Radare at PDBparse.
Ang ilang mga PDB file ay iniimbak bilang plain text, tulad ng Geneious' Program Debug Database file, at ganap na nababasa ng tao kung binuksan sa isang text editor. Maaari mong buksan ang ganitong uri ng PDB file sa anumang program na maaaring magbasa ng mga tekstong dokumento, tulad ng built-in na Notepad program sa Windows. Kasama sa ilang iba pang katugmang manonood at editor ang Notepad++ at Mga Bracket.
Ang iba pang mga PDB file ay hindi mga tekstong dokumento at kapaki-pakinabang lamang kapag binuksan gamit ang program kung saan ito nilayon. Halimbawa, kung ang sa iyo ay nauugnay sa ilang paraan sa Quicken, pagkatapos ay subukang gamitin ang software na iyon upang tingnan o i-edit ito. Inaasahan ng Visual Studio na makakita ng PDB file sa parehong folder ng DLL o EXE file.
Maaari mong tingnan at i-edit ang mga file ng Protein Data Bank sa Windows, Linux, at macOS gamit ang Avogadro. Maaaring buksan din ng mga program na ito ang file: Jmol, RasMol, QuickPDB, at USCF Chimera. Dahil ang mga ito ay plain text, maaari mo ring buksan ang isa sa isang text editor.
Dapat mabuksan ng Palm Desktop ang file na ito kung ito ay nasa format ng file ng Palm Database, ngunit maaaring kailanganin mo muna itong palitan ng pangalan upang magkaroon ng extension ng PRC file para makilala ito ng program na iyon. Ang Caliber ay isa pang opsyon.
Upang magbukas ng PalmDOC PDB file, subukan ang STDU Viewer.
Nagbukas ang Tanida Demo Builder ng mga file sa ganoong format.
Paano Mag-convert ng PDB File
Ang mga file ng database ng program ay malamang na hindi ma-convert sa ibang format ng file, kahit na hindi gamit ang isang regular na tool sa pag-convert ng file. Sa halip, kung mayroong anumang application na maaaring mag-convert ng ganitong uri ng file, ito ay ang parehong program na makakapagbukas nito.
Halimbawa, kung kailangan mong i-convert ang iyong database file mula sa Quicken, subukang gamitin ang program na iyon para gawin ito. Ang ganitong uri ng conversion, gayunpaman, ay malamang na hindi lamang maliit na gamit ngunit hindi rin sinusuportahan sa mga database application na ito (ibig sabihin, malamang na hindi mo kailangang i-convert ang ganitong uri ng PDB file sa anumang iba pang format).
Protein Data Bank file ay maaaring i-convert sa iba pang mga format gamit ang MeshLab. Upang gawin ito, maaaring kailanganin mo munang i-convert ito sa WRL gamit ang PyMOL mula sa File > Save Image As > VRML menu, at pagkatapos ay i-import ang WRL file sa MeshLab at gamitin ang File > Export Mesh As na menu upang tuluyang i-convert ang PDB file sa STL o ibang format ng file.
Kung hindi mo kailangang may kulay ang modelo, maaari mong direktang i-export ang file sa STL gamit ang USCF Chimera (nasa itaas ang download link). Kung hindi, maaari mong gamitin ang parehong paraan tulad ng nasa itaas (na may MeshLab) upang i-convert ang PDB sa WRL gamit ang USCF Chimera at pagkatapos ay i-export ang WRL sa STL gamit ang MeshLab.
Upang i-convert ang PDB sa PDF o EPUB, kung mayroon kang PalmDOC file, ay posible sa maraming paraan, ngunit ang pinakamadali ay malamang na gumamit ng online na converter tulad ng Zamzar. Maaari mong i-upload ang iyong file sa website na iyon upang magkaroon ng opsyong i-convert ito sa mga format na iyon gayundin sa AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT, at iba pang mga format ng eBook file.
Maaaring i-convert ang isa sa FASTA format gamit ang online na PDB to FASTA converter ng Meiler Lab.
Posible ring i-save ang file na ito sa CIF (Crystallographic Information format) online gamit ang PDBx/mmCIF.
Hindi pa rin ba Ito Mabuksan?
Mga file na hindi nagbubukas gamit ang alinman sa mga tool mula sa itaas, malamang na hindi talaga mga PDB file. Ang maaaring mangyari ay mali ang iyong pagkabasa sa extension ng file; ang ilang mga format ay gumagamit ng suffix na malapit na kahawig ng PDB, kapag ang mga ito ay talagang hindi nauugnay at hindi gumagana nang pareho.
Halimbawa, ang isang PDF file ay isang document file, ngunit karamihan sa mga program mula sa itaas ay hindi magre-render nang tama sa text at/o mga larawan kung susubukan mong buksan ang isa gamit ang mga software program na ito. Ang parehong ay totoo para sa iba pang mga file na may katulad na spelling ng mga extension ng file, tulad ng DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO, at WPD file.
Ang PBD ay isa pang kabilang sa EaseUS Todo Backup program at samakatuwid ay kapaki-pakinabang lamang kapag binuksan gamit ang software na iyon.
Kung wala kang PDB file, saliksikin ang file extension na mayroon ang iyong file para mahanap mo ang naaangkop na program na nagbubukas o nagko-convert nito.
Advanced Reading sa PDB Files
Marami ka pang mababasa tungkol sa mga file ng database ng program mula sa GitHub at Wintellect.
Mayroon pang matututunan tungkol sa mga file ng Protein Data Bank, din; tingnan ang Worldwide Protein Data Bank at RCSB PDB.
Mga Madalas Itanong
- Paano ko ito aayusin kapag hindi mahanap o mabuksan ng Visual Studio ang mga PDB file? Kung makakita ka ng mensaheng nagsasaad na hindi mahanap o mabuksan ng Visual Studio ang PDB file, subukan gamit ang tool sa pag-debug ng Visual Studio. Pumunta sa Tools > Options > Debugging > Symbols and piliin ang Microsoft Symbol Servers
- Paano ako magbubukas ng PDB file sa Android? Para magbukas ng PDB file sa Android, gumamit ng third-party na file reader. I-download ang Cool Reader app o anumang iba pang reader na sinusuportahan ng PDB file sa Google Play.
